| http://dbpedia.org/ontology/abstract
|
分子对接（macromolecular docking ）是分子模拟的重要方法之一，其本质是两个或多个分子之间的识别过程，其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。
, L'amarrage macromoléculaire (en anglais : … L'amarrage macromoléculaire (en anglais : macromolecular docking) est la modélisation informatique de la structure quaternaire de complexes formés par plusieurs macromolécules biologiques en interaction. Les modélisations les plus courantes étant celles des complexes protéine-protéine et protéine-acide nucléique. L'amarrage vise à prédire la structure tri-dimensionnelle du complexe telle qu'elle est dans l'organisme vivant. La procédure peut produire plusieurs structures candidates qui vont ensuite être classées suivant leur pertinence d'apparaître dans la nature. Le terme « amarrage » (en anglais docking) provient des années 1970, avec un sens plus restreint. Il s'agissait alors d'optimiser la distance entre les macromolécules tout en gardant leurs orientations relatives fixées. Par la suite, ces orientations devinrent à leur tour des paramètres à ajuster mais les structures internes des macromolécules restaient fixes. On parle alors d’amarrage fixe. Avec l'augmentation de la puissance de calcul, cette dernière contrainte fut supprimée pour prendre en compte les modifications internes susceptibles de se produire lorsque le complexe se forme. On parle ici d’amarrage flexible.e forme. On parle ici d’amarrage flexible.
, La predicción de acoplamiento proteína-pro … La predicción de acoplamiento proteína-proteína, que en el contexto de la bioinformática suele denominarse simplemente como acoplamiento proteína-proteína, y que es frecuente ver en la literatura en castellano bajo su denominación en inglés protein-protein docking o, también, docking proteína-proteína, es la determinación de la estructura molecular de complejos formados por dos o más proteínas sin la necesidad de medida experimental. El estudio del acoplamiento proteína-proteína fue estimulado por el rápido incremento en la década de 1990 de las estructuras de proteínas disponibles, y ha estado bajo investigación intensiva desde entonces. Muchas proteínas que permanecen relativamente rígidas en la formación del complejo pueden ser acopladas actualmente con éxito. Hay métodos en desarrollo para manejar casos en los que la conformación interna de una o más partes cambia sustancialmente. El acoplamiento proteína-proteína no se refiere, en general, a la descripción de la trayectoria seguida por los componentes durante la formación del complejo; el único objeto del acoplamiento es el estado final del complejo. Puesto que el uso natural del término "acoplamiento" puede sugerir guía a lo largo de una trayectoria, "acoplamiento proteína-proteína" podría ser considerada como una denominación equivocada, de la misma manera que la frecuente ausencia del término "predicción" en su uso puede hacer creer en un enfoque químico y experimental del concepto en lugar del cálculo algorítmico que es.o en lugar del cálculo algorítmico que es.
, Макромолекулярный докинг — это метод молек … Макромолекулярный докинг — это метод молекулярного моделирования четвертичной структуры комплексов, образованных двумя или более взаимодействующими биологическими макромолекулами. Чаще всего исследуются белок-белковые комплексы, реже — белок-нуклеиновые. Конечной целью докинга является предсказание трёхмерной структуры изучаемого макромолекулярного комплекса в естественной среде. Результатом докинга является набор моделей комплекса (структур). Они могут быть ранжированы различными методами, такими как для отбора наиболее правдоподобных (с большей долей вероятности встречающихся в организме). Термин «докинг» или «стыковка» появился в конце 1970-х в значении моделирования стыковки двух молекул, при котором ориентация последних не менялась (менялось только положение). С увеличением компьютерных мощностей стало возможно разрешить изменение ориентации партнёров, такой вариант докинга называется «rigid docking» или докинг жёстких тел («rigid body»). Следующим шагом стал переход к «гибкому докингу» («flexible docking»), при котором изменяется внутренняя геометрия (конформация) партнёров.тренняя геометрия (конформация) партнёров.
, Macromolecular docking is the computationa … Macromolecular docking is the computational modelling of the quaternary structure of complexes formed by two or more interacting biological macromolecules. Protein–protein complexes are the most commonly attempted targets of such modelling, followed by protein–nucleic acid complexes. The ultimate goal of docking is the prediction of the three-dimensional structure of the macromolecular complex of interest as it would occur in a living organism. Docking itself only produces plausible candidate structures. These candidates must be ranked using methods such as scoring functions to identify structures that are most likely to occur in nature. The term "docking" originated in the late 1970s, with a more restricted meaning; then, "docking" meant refining a model of a complex structure by optimizing the separation between the interactors but keeping their relative orientations fixed. Later, the relative orientations of the interacting partners in the modelling was allowed to vary, but the internal geometry of each of the partners was held fixed. This type of modelling is sometimes referred to as "rigid docking". With further increases in computational power, it became possible to model changes in internal geometry of the interacting partners that may occur when a complex is formed. This type of modelling is referred to as "flexible docking".ling is referred to as "flexible docking".
, La predicció d'acoblament proteïna-proteïn … La predicció d'acoblament proteïna-proteïna, que en el context de la bioinformàtica sol denominar-se simplement com a acoblament proteïna-proteïna, és la determinació de l'estructura molecular de complexos formats per dues o més proteïnes sense mesurar-la experimentalment. L'estudi de l'acoblament proteïna-proteïna fou estimulat pel ràpid increment a la dècada del 1990 de les estructures de proteïnes disponibles i ha estat sota investigació intensiva des d'aleshores. Moltes proteïnes que romanen relativament rígides en la formació del complex poden ser acoblades actualment amb èxit. Hi ha mètodes en desenvolupament per manejar casos en els quals la conformació interna d'una o més parts canvia de manera substancial. L'acoblament proteïna-proteïna no es refereix, en general, a la descripció de la trajectòria seguida pels components durant la formació del complex; l'únic objectiu de l'acoblament és l'estat final del complex. Com que l'ús natural del terme "acoblament" pot suggerir guia al llarg d'una trajectòria, "acoblament proteïna-proteïna" podria ser considerada com una denominació equivocada, de la mateixa manera que la freqüent absència del terme "predicció" en el seu ús pot fer creure en un enfocament químic i experimental del concepte en lloc del càlcul algorítmic que és.epte en lloc del càlcul algorítmic que és.
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID
|
2606518
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength
|
25103
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID
|
1088224260
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
|
http://dbpedia.org/resource/Inhibitor_protein +
, http://dbpedia.org/resource/Competitive_inhibitor +
, http://dbpedia.org/resource/Mutagenesis +
, http://dbpedia.org/resource/Nucleic_acid +
, http://dbpedia.org/resource/Convolution +
, http://dbpedia.org/resource/Scoring_functions_for_docking +
, http://dbpedia.org/resource/Amino-acid +
, http://dbpedia.org/resource/Antibody +
, http://dbpedia.org/resource/Physics +
, http://dbpedia.org/resource/BPTI +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Molecular_physics +
, http://dbpedia.org/resource/Docking_%28molecular%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Biomolecular_complex +
, http://dbpedia.org/resource/Double_blind +
, http://dbpedia.org/resource/Biological_process +
, http://dbpedia.org/resource/Genetic_material +
, http://dbpedia.org/resource/Macromolecule +
, http://dbpedia.org/resource/Homology_modeling +
, http://dbpedia.org/resource/Microscale_thermophoresis +
, http://dbpedia.org/resource/Protein%E2%80%93protein_interaction +
, http://dbpedia.org/resource/Interactor +
, http://dbpedia.org/resource/Sickle-cell +
, http://dbpedia.org/resource/Molecular_structure +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Protein_structure +
, http://dbpedia.org/resource/Protein_structure_prediction +
, http://dbpedia.org/resource/Structural_biology +
, http://dbpedia.org/resource/Beta-lactamase +
, http://dbpedia.org/resource/Gene_expression +
, http://dbpedia.org/resource/DNA_replication +
, http://dbpedia.org/resource/Trypsin +
, http://dbpedia.org/resource/Accessible_surface_area +
, http://dbpedia.org/resource/Heuristic +
, http://dbpedia.org/resource/Hemoglobin +
, http://dbpedia.org/resource/Protein +
, http://dbpedia.org/resource/Force_field_%28chemistry%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Convolution_theorem +
, http://dbpedia.org/resource/AMBER +
, http://dbpedia.org/resource/Function_%28biology%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Protein_engineering +
, http://dbpedia.org/resource/F%C3%B6rster_resonance_energy_transfer +
, http://dbpedia.org/resource/Hydrogen_bonds +
, http://dbpedia.org/resource/Catalysis +
, http://dbpedia.org/resource/Molecular_mechanics +
, http://dbpedia.org/resource/Metropolis-Hastings_algorithm +
, http://dbpedia.org/resource/Bound_state +
, http://dbpedia.org/resource/Mutation +
, http://dbpedia.org/resource/Molecular_geometry +
, http://dbpedia.org/resource/X-ray_crystallography +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Molecular_modelling +
, http://dbpedia.org/resource/Polymerase +
, http://dbpedia.org/resource/Cystic_fibrosis +
, http://dbpedia.org/resource/Fast_Fourier_transform +
, http://dbpedia.org/resource/Genetic_disease +
, http://dbpedia.org/resource/In_vivo +
, http://dbpedia.org/resource/CHARMM +
, http://dbpedia.org/resource/Phylogeny +
, http://dbpedia.org/resource/Monte_Carlo_method +
, http://dbpedia.org/resource/Bioinformatics +
, http://dbpedia.org/resource/Transcription_factors +
, http://dbpedia.org/resource/Biology +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Bioinformatics +
, http://dbpedia.org/resource/Surface_plasmon_resonance +
, http://dbpedia.org/resource/Complex_%28chemistry%29 +
, http://dbpedia.org/resource/Protein_quaternary_structure +
, http://dbpedia.org/resource/Isothermal_titration_calorimetry +
, http://dbpedia.org/resource/Radioligand +
, http://dbpedia.org/resource/CASP +
, http://dbpedia.org/resource/Electrostatic +
, http://dbpedia.org/resource/Structural_Classification_of_Proteins +
, http://dbpedia.org/resource/Krebs_cycle +
, http://dbpedia.org/resource/Orthogonal +
, http://dbpedia.org/resource/Computer-aided_drug_design +
, http://dbpedia.org/resource/Stereochemistry +
, http://dbpedia.org/resource/Interactome +
|
| http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate
|
http://dbpedia.org/resource/Template:Citation_needed +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Main +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Protein_methods +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Short_description +
|
| http://purl.org/dc/terms/subject
|
http://dbpedia.org/resource/Category:Bioinformatics +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Molecular_physics +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Protein_structure +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Molecular_modelling +
|
| http://purl.org/linguistics/gold/hypernym
|
http://dbpedia.org/resource/Computational +
|
| http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Macromolecular_docking?oldid=1088224260&ns=0 +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Macromolecular_docking +
|
| owl:sameAs |
http://fa.dbpedia.org/resource/%D8%AF%D8%A7%DA%A9%DB%8C%D9%86%DA%AF_%D9%85%D8%A7%DA%A9%D8%B1%D9%88%D9%85%D9%88%D9%84%DA%A9%D9%88%D9%84%DB%8C +
, http://fr.dbpedia.org/resource/Amarrage_macromol%C3%A9culaire +
, http://ru.dbpedia.org/resource/%D0%9C%D0%B0%D0%BA%D1%80%D0%BE%D0%BC%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D0%BA%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%80%D0%BD%D1%8B%D0%B9_%D0%B4%D0%BE%D0%BA%D0%B8%D0%BD%D0%B3 +
, http://ca.dbpedia.org/resource/Acoblament_prote%C3%AFna-prote%C3%AFna +
, http://dbpedia.org/resource/Macromolecular_docking +
, https://global.dbpedia.org/id/4zLyY +
, http://www.wikidata.org/entity/Q836685 +
, http://zh.dbpedia.org/resource/%E5%88%86%E5%AD%90%E5%AF%B9%E6%8E%A5 +
, http://rdf.freebase.com/ns/m.07r915 +
, http://es.dbpedia.org/resource/Predicci%C3%B3n_de_acoplamiento_prote%C3%ADna-prote%C3%ADna +
|
| rdf:type |
http://dbpedia.org/ontology/Scientist +
|
| rdfs:comment |
L'amarrage macromoléculaire (en anglais : … L'amarrage macromoléculaire (en anglais : macromolecular docking) est la modélisation informatique de la structure quaternaire de complexes formés par plusieurs macromolécules biologiques en interaction. Les modélisations les plus courantes étant celles des complexes protéine-protéine et protéine-acide nucléique. L'amarrage vise à prédire la structure tri-dimensionnelle du complexe telle qu'elle est dans l'organisme vivant. La procédure peut produire plusieurs structures candidates qui vont ensuite être classées suivant leur pertinence d'apparaître dans la nature.ur pertinence d'apparaître dans la nature.
, Macromolecular docking is the computationa … Macromolecular docking is the computational modelling of the quaternary structure of complexes formed by two or more interacting biological macromolecules. Protein–protein complexes are the most commonly attempted targets of such modelling, followed by protein–nucleic acid complexes.ollowed by protein–nucleic acid complexes.
, La predicción de acoplamiento proteína-pro … La predicción de acoplamiento proteína-proteína, que en el contexto de la bioinformática suele denominarse simplemente como acoplamiento proteína-proteína, y que es frecuente ver en la literatura en castellano bajo su denominación en inglés protein-protein docking o, también, docking proteína-proteína, es la determinación de la estructura molecular de complejos formados por dos o más proteínas sin la necesidad de medida experimental. El estudio del acoplamiento proteína-proteína fue estimulado por el rápido incremento en la década de 1990 de las estructuras de proteínas disponibles, y ha estado bajo investigación intensiva desde entonces. Muchas proteínas que permanecen relativamente rígidas en la formación del complejo pueden ser acopladas actualmente con éxito. Hay métodos en desarrollo ente con éxito. Hay métodos en desarrollo
, 分子对接（macromolecular docking ）是分子模拟的重要方法之一，其本质是两个或多个分子之间的识别过程，其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。
, Макромолекулярный докинг — это метод молек … Макромолекулярный докинг — это метод молекулярного моделирования четвертичной структуры комплексов, образованных двумя или более взаимодействующими биологическими макромолекулами. Чаще всего исследуются белок-белковые комплексы, реже — белок-нуклеиновые. Конечной целью докинга является предсказание трёхмерной структуры изучаемого макромолекулярного комплекса в естественной среде. Результатом докинга является набор моделей комплекса (структур). Они могут быть ранжированы различными методами, такими как для отбора наиболее правдоподобных (с большей долей вероятности встречающихся в организме).ей вероятности встречающихся в организме).
, La predicció d'acoblament proteïna-proteïn … La predicció d'acoblament proteïna-proteïna, que en el context de la bioinformàtica sol denominar-se simplement com a acoblament proteïna-proteïna, és la determinació de l'estructura molecular de complexos formats per dues o més proteïnes sense mesurar-la experimentalment. L'estudi de l'acoblament proteïna-proteïna fou estimulat pel ràpid increment a la dècada del 1990 de les estructures de proteïnes disponibles i ha estat sota investigació intensiva des d'aleshores. Moltes proteïnes que romanen relativament rígides en la formació del complex poden ser acoblades actualment amb èxit. Hi ha mètodes en desenvolupament per manejar casos en els quals la conformació interna d'una o més parts canvia de manera substancial. o més parts canvia de manera substancial.
|
| rdfs:label |
Amarrage macromoléculaire
, 分子对接
, Macromolecular docking
, Макромолекулярный докинг
, Predicción de acoplamiento proteína-proteína
, Acoblament proteïna-proteïna
|
