Browse Wiki & Semantic Web

Jump to: navigation, search
Http://dbpedia.org/resource/Structural genomics
  This page has no properties.
hide properties that link here 
  No properties link to this page.
 
http://dbpedia.org/resource/Structural_genomics
http://dbpedia.org/ontology/abstract علم الجينوم البنيوي (بالإنجليزية: Structural Genomics)‏ هو العلم الذي يبحث في تحديد الهياكل ثلاثية الأبعاد لعدد كبير من البروتينات باستخدام الطريقة التجريبية أو المحاكاة الحاسوبية. , La genomica strutturale si occupa della deLa genomica strutturale si occupa della determinazione della struttura tridimensionale di tutte le proteine di un dato organismo, tramite metodi sperimentali come la cristallografia a raggi X, la spettroscopia NMR o approcci computazionali come l'. Contrariamente a quanto avviene nella biologia strutturale, la determinazione della struttura proteica attraverso la genomica strutturale avviene spesso (ma non sempre) prima di conoscere la funzione proteica. Questo solleva nuove sfide per la bioinformatica strutturale, come la determinazione della funzione di una proteina dalla sua struttura tridimensionale. Mentre molti biologi strutturali si occupano della struttura di una singola proteina o di un gruppo di proteine, gli specialisti in genomica strutturale studiano le proteine di un intero genoma.Un vantaggio importante di questo approccio è il risparmio economico che si ottiene dalla clonazione, espressione e purificazione su vasta scala. D'altra parte però il valore scientifico di alcune strutture risultati è ancora dubbio.lcune strutture risultati è ancora dubbio. , 構造ゲノミクス(こうぞうゲノミクス、英語:structural genomics、構構造ゲノミクス(こうぞうゲノミクス、英語:structural genomics、構造ゲノム学とも)とは、与えられた生体の全タンパク質の三次元構造を解明する生命科学の一分野。X線結晶構造解析や核磁気共鳴分光法などの実験的方法や、ホモロジーモデリング(相同性モデリング)などの計算論的アプローチによって決定を行う。 これまでの構造生物学と違い、構造ゲノミクスにおけるタンパク質構造決定は、タンパク質の機能が全く判明していない段階で決定されることが多い。このため、構造ゲノミクスの結果は構造バイオインフォマティクスに、タンパク質の三次元構造から機能を決定する新たな課題を提起する。 構造ゲノミクスの重要な側面として、タンパク質構造の大量決定が重要な点となる。これは構造ゲノミクスの専門施設で行われる。 ほとんどの構造生物学者が個々のタンパク質やタンパク質群の構造を探究するのに対し、構造ゲノム学の専門家はゲノム規模でタンパク質の構造を探究する。このため大量のクローニングや発現、精製が必要となる。このアプローチの主な利点に規模の経済、つまり大量生産による単価の低減がある。一方、この手法で決定された構造の科学的価値に疑問の声が挙がることもある。2006年1月、サイエンス誌に構造ゲノミクスを分析した記事が掲載された。こともある。2006年1月、サイエンス誌に構造ゲノミクスを分析した記事が掲載された。 , Структурная геномика стремится описать трёСтруктурная геномика стремится описать трёхмерную структуру каждого белка, закодированного данным геномом. Используется комбинация экспериментальных и моделирующих подходов. Принципиальное различие между структурной геномикой и традиционным структурным предсказанием — это то, что структурная геномика пытается определить структуру каждого белка, закодированного геномом, вместо того, чтобы сосредоточиться на одном определенном белке. С доступными последовательностями полного генома предсказание структуры может быть сделано более быстро используя комбинацию экспериментальных и моделирующих подходов, особенно потому что доступность большого количества упорядоченных геномов и ранее решенных структур белка позволяет учёным основываться на структурах ранее решенных гомологов. Поскольку структура белка близко связана с функцией белка, структурная геномика позволяет узнать функции белка. В дополнение к объяснению функций белка структурная геномика может использоваться, чтобы идентифицировать новые сгибы белка и потенциальные цели для изобретения лекарства.енциальные цели для изобретения лекарства. , Структурна геноміка прагне описати тривиміСтруктурна геноміка прагне описати тривимірну структуру кожного білка, закодованого цим геномом. Використовується комбінація експериментальних і моделюючих підходів. Принципова відмінність між структурною геномікою і традиційним структурним пророцтвом — це те, що структурна геноміка намагається визначити структуру кожного білка, закодованого геномом, замість того, щоб зосередитися на одному певному білку. З доступними послідовностями повного генома пророцтво структури може бути зроблене швидше використовуючи комбінацію експериментальних і моделюючих підходів, особливо тому, що доступність великої кількості впорядкованих геномів і раніше встановлених структур білка дозволяє ученим ґрунтуватися на структурах раніше визначених гомологів. Оскільки структура білка тісно пов'язана з функцією білка, структурна геноміка дозволяє визначити функції білка. На додаток до пояснення функцій білка структурна геноміка може використовуватися, щоб ідентифікувати нові згини білка і потенційні цілі для винаходу ліків.ілка і потенційні цілі для винаходу ліків. , Genómica estrutural (português europeu) ou genômica estrutural (português brasileiro) é um campo de investigação que tem como objetivo caracterizar e localizar os vários genes de um genoma. , Structural genomics seeks to describe the Structural genomics seeks to describe the 3-dimensional structure of every protein encoded by a given genome. This genome-based approach allows for a high-throughput method of structure determination by a combination of experimental and modeling approaches. The principal difference between structural genomics and traditional structural prediction is that structural genomics attempts to determine the structure of every protein encoded by the genome, rather than focusing on one particular protein. With full-genome sequences available, structure prediction can be done more quickly through a combination of experimental and modeling approaches, especially because the availability of large number of sequenced genomes and previously solved protein structures allows scientists to model protein structure on the structures of previously solved homologs. Because protein structure is closely linked with protein function, the structural genomics has the potential to inform knowledge of protein function. In addition to elucidating protein functions, structural genomics can be used to identify novel protein folds and potential targets for drug discovery. Structural genomics involves taking a large number of approaches to structure determination, including experimental methods using genomic sequences or modeling-based approaches based on sequence or structural homology to a protein of known structure or based on chemical and physical principles for a protein with no homology to any known structure. As opposed to traditional structural biology, the determination of a protein structure through a structural genomics effort often (but not always) comes before anything is known regarding the protein function. This raises new challenges in structural bioinformatics, i.e. determining protein function from its 3D structure. Structural genomics emphasizes high throughput determination of protein structures. This is performed in dedicated centers of structural genomics. While most structural biologists pursue structures of individual proteins or protein groups, specialists in structural genomics pursue structures of proteins on a genome wide scale. This implies large-scale cloning, expression and purification. One main advantage of this approach is economy of scale. On the other hand, the scientific value of some resultant structures is at times questioned. A Science article from January 2006 analyzes the structural genomics field. One advantage of structural genomics, such as the Protein Structure Initiative, is that the scientific community gets immediate access to new structures, as well as to reagents such as clones and protein. A disadvantage is that many of these structures are of proteins of unknown function and do not have corresponding publications. This requires new ways of communicating this structural information to the broader research community. The Bioinformatics core of the Joint center for structural genomics (JCSG) has recently developed a wiki-based approach namely Open protein structure annotation network (TOPSAN) for annotating protein structures emerging from high-throughput structural genomics centers.gh-throughput structural genomics centers. , 結構基因組學是一門用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白質結構基因組學是一門用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白質和相关蛋白質复合物的三维結構的学科。主要利用實驗方式(X射線晶體学、核磁共振波谱法和电子显微学)来测定蛋白质结构,同时结合同源建模(homology modelling)这一計算方式来推测蛋白质结构。和傳統結構生物學不同的是,利用結構基因組學所測定的蛋白質結構通常是功能未知的蛋白質。這令科學家創立了結構生物信息學,利用三維結構信息來预测蛋白質功能。結構基因組學重視快速、高通量(high throughput)的蛋白質結構測定,而同步辐射装置是实现这一目标的重要实验装置之一。roughput)的蛋白質結構測定,而同步辐射装置是实现这一目标的重要实验装置之一。 , La genómica estructural consiste en la detLa genómica estructural consiste en la determinación de la conformación tridimensional de todas las proteínas codificadas por un genoma dado, con el propósito de facilitar la caracterización funcional de proteínas basada en su secuencia​ y la obtención de estructuras desconocidas a partir de proteínas con secuencias homólogas de aminoácidos analizadas con esta técnica.​ Mientras que la investigación en biología estructural se centra en la obtención y análisis de una proteína o grupo de proteínas aisladas o formando complejos supramoleculares cuya función es, por lo general, conocida, la genómica estructural enfatiza la identificación y descripción de nuevas conformaciones estructurales y pliegues; la predicción de la función, si es desconocida, tiene lugar mediante métodos bioinformáticos. Los grupos de genómica estructura operan a gran escala y las tareas de clonación de ADN, expresión, purificación, determinación y análisis estructural están distribuidas entre varios laboratorios formando centros o consorcios.aboratorios formando centros o consorcios.
http://dbpedia.org/ontology/thumbnail http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Argonne%27s_Midwest_Center_for_Structural_Genomics_deposits_1%2C000th_protein_structure.jpg?width=300 +
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageExternalLink http://content.wkhealth.com/linkback/openurl%3Fissn=1175-5636&volume=2&issue=3&spage=S3 + , http://www.nigms.nih.gov/Research/specificareas/PSI/ + , http://sbkb.org/ +
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID 303101
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength 14111
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID 1100626773
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink http://dbpedia.org/resource/Structural_biology + , http://dbpedia.org/resource/Protein_Structure_Initiative + , http://dbpedia.org/resource/Protein_Data_Bank + , http://dbpedia.org/resource/Structural_bioinformatics + , http://dbpedia.org/resource/Mycobacterium_tuberculosis + , http://dbpedia.org/resource/Peptide_sequence + , http://dbpedia.org/resource/Protein_structure_prediction + , http://dbpedia.org/resource/Rosetta@home + , http://dbpedia.org/resource/Thermotoga + , http://dbpedia.org/resource/Mycobacterium_Tuberculosis_Structural_Genomics_Consortium + , http://dbpedia.org/resource/Escherichia_coli + , http://dbpedia.org/resource/Category:Structural_biology + , http://dbpedia.org/resource/Category:Genomics + , http://dbpedia.org/resource/Open_protein_structure_annotation_network + , http://dbpedia.org/resource/UniProt + , http://dbpedia.org/resource/Genomics + , http://dbpedia.org/resource/CATH + , http://dbpedia.org/resource/Structural_proteomics + , http://dbpedia.org/resource/X-ray_crystallography + , http://dbpedia.org/resource/Category:Bioinformatics + , http://dbpedia.org/resource/File:Argonne%27s_Midwest_Center_for_Structural_Genomics_deposits_1%2C000th_protein_structure.jpg + , http://dbpedia.org/resource/Omics + , http://dbpedia.org/resource/Protein_structure + , http://dbpedia.org/resource/Structural_Classification_of_Proteins + , http://dbpedia.org/resource/Multi-drug-resistant_tuberculosis + , http://dbpedia.org/resource/Protein_Structure + , http://dbpedia.org/resource/Homology_modeling + , http://dbpedia.org/resource/Category:Genome_projects + , http://dbpedia.org/resource/Open_reading_frame + , http://dbpedia.org/resource/Genome + , http://dbpedia.org/resource/National_Institutes_of_Health + , http://dbpedia.org/resource/De_novo_protein_structure_prediction + , http://dbpedia.org/resource/Threading_%28protein_sequence%29 + , http://dbpedia.org/resource/Messenger_RNA + , http://dbpedia.org/resource/Joint_Center_for_Structural_Genomics + , http://dbpedia.org/resource/Protein_nuclear_magnetic_resonance_spectroscopy + , http://dbpedia.org/resource/Three-dimensional_space +
http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist + , http://dbpedia.org/resource/Template:Cite_journal + , http://dbpedia.org/resource/Template:Refend + , http://dbpedia.org/resource/Template:Refbegin + , http://dbpedia.org/resource/Template:Portal + , http://dbpedia.org/resource/Template:Genomics +
http://purl.org/dc/terms/subject http://dbpedia.org/resource/Category:Bioinformatics + , http://dbpedia.org/resource/Category:Genomics + , http://dbpedia.org/resource/Category:Structural_biology + , http://dbpedia.org/resource/Category:Genome_projects +
http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom http://en.wikipedia.org/wiki/Structural_genomics?oldid=1100626773&ns=0 +
http://xmlns.com/foaf/0.1/depiction http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Argonne%27s_Midwest_Center_for_Structural_Genomics_deposits_1%2C000th_protein_structure.jpg +
http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf http://en.wikipedia.org/wiki/Structural_genomics +
owl:sameAs https://global.dbpedia.org/id/2Rfd6 + , http://es.dbpedia.org/resource/Gen%C3%B3mica_estructural + , http://it.dbpedia.org/resource/Genomica_strutturale + , http://ru.dbpedia.org/resource/%D0%A1%D1%82%D1%80%D1%83%D0%BA%D1%82%D1%83%D1%80%D0%BD%D0%B0%D1%8F_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%BE%D0%BC%D0%B8%D0%BA%D0%B0 + , http://hi.dbpedia.org/resource/%E0%A4%B8%E0%A4%82%E0%A4%B0%E0%A4%9A%E0%A4%A8%E0%A4%BE_%E0%A4%9C%E0%A5%80%E0%A4%A8%E0%A5%8B%E0%A4%AE%E0%A4%BF%E0%A4%95%E0%A5%8D%E0%A4%B8 + , http://ar.dbpedia.org/resource/%D8%B9%D9%84%D9%85_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%8A%D9%86%D9%88%D9%85_%D8%A7%D9%84%D8%A8%D9%86%D9%8A%D9%88%D9%8A + , http://pt.dbpedia.org/resource/Gen%C3%B3mica_estrutural + , http://rdf.freebase.com/ns/m.01s4gg + , http://dbpedia.org/resource/Structural_genomics + , http://ja.dbpedia.org/resource/%E6%A7%8B%E9%80%A0%E3%82%B2%E3%83%8E%E3%83%9F%E3%82%AF%E3%82%B9 + , http://zh.dbpedia.org/resource/%E7%BB%93%E6%9E%84%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E5%AD%A6 + , http://is.dbpedia.org/resource/Byggingar_erf%C3%B0amengjafr%C3%A6%C3%B0i + , http://sh.dbpedia.org/resource/Strukturna_genomika + , http://sr.dbpedia.org/resource/Strukturna_genomika + , http://uk.dbpedia.org/resource/%D0%A1%D1%82%D1%80%D1%83%D0%BA%D1%82%D1%83%D1%80%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%BE%D0%BC%D1%96%D0%BA%D0%B0 + , http://fa.dbpedia.org/resource/%DA%98%D9%86%D9%88%D9%85%DB%8C%DA%A9_%D8%B3%D8%A7%D8%AE%D8%AA%D8%A7%D8%B1%DB%8C + , http://www.wikidata.org/entity/Q2583975 +
rdfs:comment 結構基因組學是一門用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白質結構基因組學是一門用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白質和相关蛋白質复合物的三维結構的学科。主要利用實驗方式(X射線晶體学、核磁共振波谱法和电子显微学)来测定蛋白质结构,同时结合同源建模(homology modelling)这一計算方式来推测蛋白质结构。和傳統結構生物學不同的是,利用結構基因組學所測定的蛋白質結構通常是功能未知的蛋白質。這令科學家創立了結構生物信息學,利用三維結構信息來预测蛋白質功能。結構基因組學重視快速、高通量(high throughput)的蛋白質結構測定,而同步辐射装置是实现这一目标的重要实验装置之一。roughput)的蛋白質結構測定,而同步辐射装置是实现这一目标的重要实验装置之一。 , Structural genomics seeks to describe the Structural genomics seeks to describe the 3-dimensional structure of every protein encoded by a given genome. This genome-based approach allows for a high-throughput method of structure determination by a combination of experimental and modeling approaches. The principal difference between structural genomics and traditional structural prediction is that structural genomics attempts to determine the structure of every protein encoded by the genome, rather than focusing on one particular protein. With full-genome sequences available, structure prediction can be done more quickly through a combination of experimental and modeling approaches, especially because the availability of large number of sequenced genomes and previously solved protein structures allows scientists to model protein strres allows scientists to model protein str , 構造ゲノミクス(こうぞうゲノミクス、英語:structural genomics、構構造ゲノミクス(こうぞうゲノミクス、英語:structural genomics、構造ゲノム学とも)とは、与えられた生体の全タンパク質の三次元構造を解明する生命科学の一分野。X線結晶構造解析や核磁気共鳴分光法などの実験的方法や、ホモロジーモデリング(相同性モデリング)などの計算論的アプローチによって決定を行う。 これまでの構造生物学と違い、構造ゲノミクスにおけるタンパク質構造決定は、タンパク質の機能が全く判明していない段階で決定されることが多い。このため、構造ゲノミクスの結果は構造バイオインフォマティクスに、タンパク質の三次元構造から機能を決定する新たな課題を提起する。 構造ゲノミクスの重要な側面として、タンパク質構造の大量決定が重要な点となる。これは構造ゲノミクスの専門施設で行われる。 ほとんどの構造生物学者が個々のタンパク質やタンパク質群の構造を探究するのに対し、構造ゲノム学の専門家はゲノム規模でタンパク質の構造を探究する。このため大量のクローニングや発現、精製が必要となる。このアプローチの主な利点に規模の経済、つまり大量生産による単価の低減がある。一方、この手法で決定された構造の科学的価値に疑問の声が挙がることもある。2006年1月、サイエンス誌に構造ゲノミクスを分析した記事が掲載された。こともある。2006年1月、サイエンス誌に構造ゲノミクスを分析した記事が掲載された。 , علم الجينوم البنيوي (بالإنجليزية: Structural Genomics)‏ هو العلم الذي يبحث في تحديد الهياكل ثلاثية الأبعاد لعدد كبير من البروتينات باستخدام الطريقة التجريبية أو المحاكاة الحاسوبية. , La genomica strutturale si occupa della determinazione della struttura tridimensionale di tutte le proteine di un dato organismo, tramite metodi sperimentali come la cristallografia a raggi X, la spettroscopia NMR o approcci computazionali come l'. , Структурна геноміка прагне описати тривиміСтруктурна геноміка прагне описати тривимірну структуру кожного білка, закодованого цим геномом. Використовується комбінація експериментальних і моделюючих підходів. Принципова відмінність між структурною геномікою і традиційним структурним пророцтвом — це те, що структурна геноміка намагається визначити структуру кожного білка, закодованого геномом, замість того, щоб зосередитися на одному певному білку. З доступними послідовностями повного генома пророцтво структури може бути зроблене швидше використовуючи комбінацію експериментальних і моделюючих підходів, особливо тому, що доступність великої кількості впорядкованих геномів і раніше встановлених структур білка дозволяє ученим ґрунтуватися на структурах раніше визначених гомологів.на структурах раніше визначених гомологів. , Genómica estrutural (português europeu) ou genômica estrutural (português brasileiro) é um campo de investigação que tem como objetivo caracterizar e localizar os vários genes de um genoma. , Структурная геномика стремится описать трёСтруктурная геномика стремится описать трёхмерную структуру каждого белка, закодированного данным геномом. Используется комбинация экспериментальных и моделирующих подходов. Принципиальное различие между структурной геномикой и традиционным структурным предсказанием — это то, что структурная геномика пытается определить структуру каждого белка, закодированного геномом, вместо того, чтобы сосредоточиться на одном определенном белке. С доступными последовательностями полного генома предсказание структуры может быть сделано более быстро используя комбинацию экспериментальных и моделирующих подходов, особенно потому что доступность большого количества упорядоченных геномов и ранее решенных структур белка позволяет учёным основываться на структурах ранее решенных гомологов.ся на структурах ранее решенных гомологов. , La genómica estructural consiste en la detLa genómica estructural consiste en la determinación de la conformación tridimensional de todas las proteínas codificadas por un genoma dado, con el propósito de facilitar la caracterización funcional de proteínas basada en su secuencia​ y la obtención de estructuras desconocidas a partir de proteínas con secuencias homólogas de aminoácidos analizadas con esta técnica.​ Mientras que la investigación en biología estructural se centra en la obtención y análisis de una proteína o grupo de proteínas aisladas o formando complejos supramoleculares cuya función es, por lo general, conocida, la genómica estructural enfatiza la identificación y descripción de nuevas conformaciones estructurales y pliegues; la predicción de la función, si es desconocida, tiene lugar mediante métodos bioinformáticos.ne lugar mediante métodos bioinformáticos.
rdfs:label Структурная геномика , 構造ゲノミクス , Genomica strutturale , Genómica estructural , Structural genomics , Genómica estrutural , علم الجينوم البنيوي , 结构基因组学 , Структурна геноміка
hide properties that link here 
http://dbpedia.org/resource/Thermus_thermophilus + , http://dbpedia.org/resource/Omics + , http://dbpedia.org/resource/Index_of_biophysics_articles + , http://dbpedia.org/resource/University_of_Georgia + , http://dbpedia.org/resource/Nuclear_magnetic_resonance_spectroscopy_of_proteins + , http://dbpedia.org/resource/Protein_primary_structure + , http://dbpedia.org/resource/Sequence_profiling_tool + , http://dbpedia.org/resource/Jute_genome + , http://dbpedia.org/resource/Tuberculosis_Structural_Genomics_Consortium + , http://dbpedia.org/resource/Gene_prediction + , http://dbpedia.org/resource/Structural_alignment + , http://dbpedia.org/resource/Protein_structure_prediction + , http://dbpedia.org/resource/Protein_function_prediction + , http://dbpedia.org/resource/Genomics + , http://dbpedia.org/resource/Structural_biology + , http://dbpedia.org/resource/Homology_modeling + , http://dbpedia.org/resource/Protein_Structure_Initiative + , http://dbpedia.org/resource/Protein_Data_Bank + , http://dbpedia.org/resource/John_Bell_%28physician%29 + , http://dbpedia.org/resource/Lukasz_Kurgan + , http://dbpedia.org/resource/Nucleosome_positioning_region_database + , http://dbpedia.org/resource/Sequence_clustering + , http://dbpedia.org/resource/Domain_of_unknown_function + , http://dbpedia.org/resource/Protein + , http://dbpedia.org/resource/Biotechnology + , http://dbpedia.org/resource/Index_of_genetics_articles + , http://dbpedia.org/resource/Maria_Arm%C3%A9nia_Carrondo + , http://dbpedia.org/resource/Structural_Genomics_Consortium + , http://dbpedia.org/resource/Open_protein_structure_annotation_network + , http://dbpedia.org/resource/Computational_history + , http://dbpedia.org/resource/Computational_biology + , http://dbpedia.org/resource/Functional_genomics + , http://dbpedia.org/resource/Mary_Jo_Ondrechen + , http://dbpedia.org/resource/Toxicogenomics + , http://dbpedia.org/resource/Threading_%28protein_sequence%29 + , http://dbpedia.org/resource/Photon_Factory + , http://dbpedia.org/resource/Genome@home + , http://dbpedia.org/resource/1-phosphofructokinase + , http://dbpedia.org/resource/Structural_proteomics + http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
http://en.wikipedia.org/wiki/Structural_genomics + http://xmlns.com/foaf/0.1/primaryTopic
http://dbpedia.org/resource/Structural_genomics + owl:sameAs
 

 

Enter the name of the page to start semantic browsing from.