Browse Wiki & Semantic Web

Jump to: navigation, search
Http://dbpedia.org/resource/Similarity Matrix of Proteins
  This page has no properties.
hide properties that link here 
  No properties link to this page.
 
http://dbpedia.org/resource/Similarity_Matrix_of_Proteins
http://dbpedia.org/ontology/abstract SIMAP — расшифровывается как «Similarity MSIMAP — расшифровывается как «Similarity Matrix of Proteins», представляет собой базу данных о сходстве белков, созданную с помощью добровольных вычислений, которая свободно доступна для научных целей. SIMAP использует алгоритм FASTA для предвычисления сходства белков, пока другое приложение использует скрытую Марковскую модель для поиска доменов белка. SIMAP является совместным проектом Мюнхенского технического университета и . В четвертом квартале 2010 года, проект переехал в Венский университет. C 2011 года, данные SIMAP используются в базе данных белок-белковых взаимодействий STRING (с версии 9.0), вместо данных BLAST, выполненных для предыдущих версий STRING. Проект обычно выдает задания в начале каждого месяца. Проект SIMAP закрыт в 2014 году. Разработчиками анонсирован SIMAP 2. году. Разработчиками анонсирован SIMAP 2. , Similarity Matrix of Proteins (SIMAP) is aSimilarity Matrix of Proteins (SIMAP) is a database of protein similarities created using volunteer computing. It is freely accessible for scientific purposes. SIMAP uses the FASTA algorithm to precalculate protein similarity, while another application uses hidden Markov models to search for protein domains. SIMAP is a joint project of the Technical University of Munich, the Helmholtz Zentrum München, and the University of Vienna.rum München, and the University of Vienna. , SIMAP (Similarity Matrix of Proteins) は分散コSIMAP (Similarity Matrix of Proteins) は分散コンピューティングを用いて運用されているタンパク質類似性のデータベースであり、ミュンヘン工科大学とen:Helmholtz Zentrum Münchenによる合同プロジェクトとして管理されている。利用者は科学的目的のために自由にアクセスすることができる。同様の他のアプリケーションではタンパク質ドメインを探すために隠れマルコフモデルが用いられているのに対し、SIMAPはタンパク質類似性を事前計算するために FASTAアルゴリズムを用いている。 なお2014/5/30に2014年をもってboincプロジェクトの終了が発表された。なお2014/5/30に2014年をもってboincプロジェクトの終了が発表された。 , مصفوفة تشابه البروتينات (سيماب)، تُعرّف بأمصفوفة تشابه البروتينات (سيماب)، تُعرّف بأنّها قاعدة بيانات لتشابهات البروتينات التي صُنعت باستخدام الحوسبة الموّزعة، وتُعتبر مُتاحة مجانًا للأغراض العلمية. تستخدم سيماب خوارزمية فاستا (المعروفة بأنها برنامج لتحليل الحمض النووي وبيانات سلسلة البروتين) للحساب المسبق لتشابه البروتين بينما يستخدم تطبيقُ آخر نماذجَ ماركوف المخفيّة للبحث عن نطاقات البروتين. تُعتبر (سيماب) مشروعا مشتركاً يضمّ جامعة ميونخ التقنية والمركز البحثيّ الألمانيّ للصحة البيئية وجامعة فيينا.حثيّ الألمانيّ للصحة البيئية وجامعة فيينا. , Similarity Matrix of Proteins, ou SIMAP, eSimilarity Matrix of Proteins, ou SIMAP, est une base de données de similitude entre protéines et des domaines protéiniques. Celle-ci rassemble toutes les séquences de protéines actuellement publiées et est continuellement mise à jour. Les similitudes entre protéines sont calculées à l'aide de l'algorithme FASTA qui fournit une vitesse optimale et une sensibilité nécessaire. Les domaines de protéines sont calculés en utilisant la base de données et les méthodes d'InterPro. SIMAP est un projet commun du centre national de recherches GSF pour l'environnement et la santé, de l'université technique de Munich, et du centre de la vie et des sciences de l'alimentation Weihenstephan.L'utilisation des résultats de SIMAP est entièrement libre pour l'éducation et la recherche publique. SIMAP utilise la plateforme de calcul distribué BOINC. Grâce à l'utilisation de BOINC, chacun peut participer, avec son ordinateur personnel, à la mise à jour continue de la base de données. Statistiques de SIMAP au 30 juin 2011: Le projet dans sa 1re version est maintenant fermé. BoincSimap will closest maintenant fermé. BoincSimap will close , SIMAP (Similarity Matrix of Proteins; dt.:SIMAP (Similarity Matrix of Proteins; dt.: Ähnlichkeitsmatrix für Proteine) ist eine Datenbank für Proteinähnlichkeiten. Diese Datenbank beinhaltet alle bisher veröffentlichten Proteinsequenzen und wird fortlaufend aktualisiert. Ähnlichkeiten der Proteine werden dabei unter Verwendung des FASTA-Algorithmus berechnet. Es handelt sich um die bisher einzige derartige Datenbank, die tatsächlich alle bisher bekannten Proteine mit einbezieht. Seit 2014 wird eine neue SIMAP-Datenbank (SIMAP2) entwickelt. SIMAP2 verwendet den exakten Smith-Waterman-Algorithmus und soll daher eine bessere Empfindlichkeit als das ursprüngliche Projekt erreichen. Dieses wurde Ende 2014 letztmals aktualisiert, bleibt aber noch so lange online, wie es wissenschaftlich relevant ist. SIMAP2 wird nicht mehr mit BOINCSIMAP, sondern mit einem Hochleistungscomputer der Universität Wien berechnet.gscomputer der Universität Wien berechnet. , Similarity Matrix of Proteins nebo častějiSimilarity Matrix of Proteins nebo častěji SIMAP je BOINC projekt, který slouží k výzkumu funkcí proteinů. Aplikace simap hledá pomocí FASTA heuristiky (jejíž výsledky jsou zpřesněny pomocí Smith-Watermanova algoritmu) podobnosti v primární struktuře proteinů, aplikace hmmer využívající skryté Markovovy modely (Hidden Markov Models) lokalizuje v proteinu jednotlivé domény. Zdroje dat pro SIMAP@home představují veřejně přístupné vědecké databáze jako UniProt, RCSB PDB, GenBank nebo RefSeq shromažďující informace o struktuře a funkci dosud objevených proteinů. Pro odhad proteinových domén se využívá informací o známých doménách a sekvenčních vzorech z databáze InterPro. Výsledky výpočtů se ukládají do veřejně přístupné vědecké databáze.ají do veřejně přístupné vědecké databáze. , SIMAP (del inglés SImiliarity MAtrix of PrSIMAP (del inglés SImiliarity MAtrix of Proteins, o matriz de similitud de proteínas) es una base de datos de similitudes entre proteínas creada usando computación distribuida, y que es libremente accesible para propósitos científicos. SIMAP utiliza el algoritmo de FASTA para precalcular la similitud de las proteínas, mientras que otra aplicación utiliza modelos ocultos de Márkov para identificar dominios proteicos. La base de datos ha sido completada, pero se actualizará para descubrimientos de nuevas proteínas. para descubrimientos de nuevas proteínas. , SIMAP是一个BOINC计算项目,预先计算蛋白相似之处,在许多生物信息学方法中发挥了关键作用。它包含目前所有已发布蛋白质序列,并在不断更新。保持SIMAP最新的计算在不断增加。迄今为止,进行蛋白质序列比较是研究生物学中的蛋白质序列特点最有力的工具,因为大量的信息保存在整个进化过程中。參與志願者的计算可以支持多种生物研究项目。2014年底,SIMAP離開BOINC。 , Il Similarity Matrix of Proteins (SIMAP) èIl Similarity Matrix of Proteins (SIMAP) è un database pubblico che archivia dati sulle sequenze proteiche ed utilizza il calcolo distribuito per rilevarne le somiglianze. Utilizza il Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) come piattaforma per il calcolo distribuito. Il progetto è stato chiuso a maggio 2014. Il progetto è stato chiuso a maggio 2014.
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageExternalLink http://cube.univie.ac.at/resources/simap/ +
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID 3410567
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength 3697
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID 1109660826
http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink http://dbpedia.org/resource/Technical_University_of_Munich + , http://dbpedia.org/resource/Protein + , http://dbpedia.org/resource/Berkeley_Open_Infrastructure_for_Network_Computing + , http://dbpedia.org/resource/Megabyte + , http://dbpedia.org/resource/Predictor@home + , http://dbpedia.org/resource/Database + , http://dbpedia.org/resource/Mac_OS + , http://dbpedia.org/resource/Smith-Waterman_algorithm + , http://dbpedia.org/resource/Volunteer_computing + , http://dbpedia.org/resource/X86-64 + , http://dbpedia.org/resource/Protein_sequence + , http://dbpedia.org/resource/Protein_domain + , http://dbpedia.org/resource/University_of_Vienna + , http://dbpedia.org/resource/Helmholtz_Zentrum_M%C3%BCnchen + , http://dbpedia.org/resource/Android_%28operating_system%29 + , http://dbpedia.org/resource/Distributed_computing + , http://dbpedia.org/resource/Linux + , http://dbpedia.org/resource/FASTA + , http://dbpedia.org/resource/BOINC + , http://dbpedia.org/resource/Operating_Systems + , http://dbpedia.org/resource/Streaming_SIMD_Extensions + , http://dbpedia.org/resource/Rosetta@home + , http://dbpedia.org/resource/Category:Free_science_software + , http://dbpedia.org/resource/Metagenome + , http://dbpedia.org/resource/Category:Science_in_society + , http://dbpedia.org/resource/Hidden_Markov_model + , http://dbpedia.org/resource/Microsoft_Windows + , http://dbpedia.org/resource/URL + , http://dbpedia.org/resource/Folding@home + , http://dbpedia.org/resource/Category:Volunteer_computing_projects +
http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate http://dbpedia.org/resource/Template:Science-software-stub + , http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist + , http://dbpedia.org/resource/Template:BOINC_topics + , http://dbpedia.org/resource/Template:Short_description + , http://dbpedia.org/resource/Template:Cn +
http://purl.org/dc/terms/subject http://dbpedia.org/resource/Category:Volunteer_computing_projects + , http://dbpedia.org/resource/Category:Free_science_software + , http://dbpedia.org/resource/Category:Science_in_society +
http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom http://en.wikipedia.org/wiki/Similarity_Matrix_of_Proteins?oldid=1109660826&ns=0 +
http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf http://en.wikipedia.org/wiki/Similarity_Matrix_of_Proteins +
owl:sameAs http://cs.dbpedia.org/resource/SIMAP + , http://zh.dbpedia.org/resource/SIMAP + , http://ar.dbpedia.org/resource/%D9%85%D8%B5%D9%81%D9%88%D9%81%D8%A9_%D8%AA%D8%B4%D8%A7%D8%A8%D9%87_%D8%A7%D9%84%D8%A8%D8%B1%D9%88%D8%AA%D9%8A%D9%86%D8%A7%D8%AA + , http://dbpedia.org/resource/Similarity_Matrix_of_Proteins + , http://ja.dbpedia.org/resource/SIMAP + , http://fr.dbpedia.org/resource/Similarity_Matrix_of_Proteins + , https://global.dbpedia.org/id/TzfV + , http://de.dbpedia.org/resource/SIMAP + , http://www.wikidata.org/entity/Q1459271 + , http://es.dbpedia.org/resource/SIMAP + , http://ru.dbpedia.org/resource/SIMAP@home + , http://it.dbpedia.org/resource/SIMAP +
rdfs:comment Il Similarity Matrix of Proteins (SIMAP) èIl Similarity Matrix of Proteins (SIMAP) è un database pubblico che archivia dati sulle sequenze proteiche ed utilizza il calcolo distribuito per rilevarne le somiglianze. Utilizza il Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) come piattaforma per il calcolo distribuito. Il progetto è stato chiuso a maggio 2014. Il progetto è stato chiuso a maggio 2014. , مصفوفة تشابه البروتينات (سيماب)، تُعرّف بأمصفوفة تشابه البروتينات (سيماب)، تُعرّف بأنّها قاعدة بيانات لتشابهات البروتينات التي صُنعت باستخدام الحوسبة الموّزعة، وتُعتبر مُتاحة مجانًا للأغراض العلمية. تستخدم سيماب خوارزمية فاستا (المعروفة بأنها برنامج لتحليل الحمض النووي وبيانات سلسلة البروتين) للحساب المسبق لتشابه البروتين بينما يستخدم تطبيقُ آخر نماذجَ ماركوف المخفيّة للبحث عن نطاقات البروتين. تُعتبر (سيماب) مشروعا مشتركاً يضمّ جامعة ميونخ التقنية والمركز البحثيّ الألمانيّ للصحة البيئية وجامعة فيينا.حثيّ الألمانيّ للصحة البيئية وجامعة فيينا. , Similarity Matrix of Proteins (SIMAP) is aSimilarity Matrix of Proteins (SIMAP) is a database of protein similarities created using volunteer computing. It is freely accessible for scientific purposes. SIMAP uses the FASTA algorithm to precalculate protein similarity, while another application uses hidden Markov models to search for protein domains. SIMAP is a joint project of the Technical University of Munich, the Helmholtz Zentrum München, and the University of Vienna.rum München, and the University of Vienna. , Similarity Matrix of Proteins, ou SIMAP, eSimilarity Matrix of Proteins, ou SIMAP, est une base de données de similitude entre protéines et des domaines protéiniques. Celle-ci rassemble toutes les séquences de protéines actuellement publiées et est continuellement mise à jour. Les similitudes entre protéines sont calculées à l'aide de l'algorithme FASTA qui fournit une vitesse optimale et une sensibilité nécessaire. Les domaines de protéines sont calculés en utilisant la base de données et les méthodes d'InterPro. Statistiques de SIMAP au 30 juin 2011: Le projet dans sa 1re version est maintenant fermé. BoincSimap will closest maintenant fermé. BoincSimap will close , SIMAP (Similarity Matrix of Proteins) は分散コSIMAP (Similarity Matrix of Proteins) は分散コンピューティングを用いて運用されているタンパク質類似性のデータベースであり、ミュンヘン工科大学とen:Helmholtz Zentrum Münchenによる合同プロジェクトとして管理されている。利用者は科学的目的のために自由にアクセスすることができる。同様の他のアプリケーションではタンパク質ドメインを探すために隠れマルコフモデルが用いられているのに対し、SIMAPはタンパク質類似性を事前計算するために FASTAアルゴリズムを用いている。 なお2014/5/30に2014年をもってboincプロジェクトの終了が発表された。なお2014/5/30に2014年をもってboincプロジェクトの終了が発表された。 , SIMAP (del inglés SImiliarity MAtrix of PrSIMAP (del inglés SImiliarity MAtrix of Proteins, o matriz de similitud de proteínas) es una base de datos de similitudes entre proteínas creada usando computación distribuida, y que es libremente accesible para propósitos científicos. SIMAP utiliza el algoritmo de FASTA para precalcular la similitud de las proteínas, mientras que otra aplicación utiliza modelos ocultos de Márkov para identificar dominios proteicos. La base de datos ha sido completada, pero se actualizará para descubrimientos de nuevas proteínas. para descubrimientos de nuevas proteínas. , Similarity Matrix of Proteins nebo častějiSimilarity Matrix of Proteins nebo častěji SIMAP je BOINC projekt, který slouží k výzkumu funkcí proteinů. Aplikace simap hledá pomocí FASTA heuristiky (jejíž výsledky jsou zpřesněny pomocí Smith-Watermanova algoritmu) podobnosti v primární struktuře proteinů, aplikace hmmer využívající skryté Markovovy modely (Hidden Markov Models) lokalizuje v proteinu jednotlivé domény. Zdroje dat pro SIMAP@home představují veřejně přístupné vědecké databáze jako UniProt, RCSB PDB, GenBank nebo RefSeq shromažďující informace o struktuře a funkci dosud objevených proteinů. Pro odhad proteinových domén se využívá informací o známých doménách a sekvenčních vzorech z databáze InterPro. Výsledky výpočtů se ukládají do veřejně přístupné vědecké databáze.ají do veřejně přístupné vědecké databáze. , SIMAP — расшифровывается как «Similarity MSIMAP — расшифровывается как «Similarity Matrix of Proteins», представляет собой базу данных о сходстве белков, созданную с помощью добровольных вычислений, которая свободно доступна для научных целей. SIMAP использует алгоритм FASTA для предвычисления сходства белков, пока другое приложение использует скрытую Марковскую модель для поиска доменов белка. SIMAP является совместным проектом Мюнхенского технического университета и . В четвертом квартале 2010 года, проект переехал в Венский университет. Проект обычно выдает задания в начале каждого месяца.но выдает задания в начале каждого месяца. , SIMAP是一个BOINC计算项目,预先计算蛋白相似之处,在许多生物信息学方法中发挥了关键作用。它包含目前所有已发布蛋白质序列,并在不断更新。保持SIMAP最新的计算在不断增加。迄今为止,进行蛋白质序列比较是研究生物学中的蛋白质序列特点最有力的工具,因为大量的信息保存在整个进化过程中。參與志願者的计算可以支持多种生物研究项目。2014年底,SIMAP離開BOINC。 , SIMAP (Similarity Matrix of Proteins; dt.:SIMAP (Similarity Matrix of Proteins; dt.: Ähnlichkeitsmatrix für Proteine) ist eine Datenbank für Proteinähnlichkeiten. Diese Datenbank beinhaltet alle bisher veröffentlichten Proteinsequenzen und wird fortlaufend aktualisiert. Ähnlichkeiten der Proteine werden dabei unter Verwendung des FASTA-Algorithmus berechnet. Es handelt sich um die bisher einzige derartige Datenbank, die tatsächlich alle bisher bekannten Proteine mit einbezieht. Seit 2014 wird eine neue SIMAP-Datenbank (SIMAP2) entwickelt. SIMAP2 verwendet den exakten Smith-Waterman-Algorithmus und soll daher eine bessere Empfindlichkeit als das ursprüngliche Projekt erreichen. Dieses wurde Ende 2014 letztmals aktualisiert, bleibt aber noch so lange online, wie es wissenschaftlich relevant ist. SIMAP2 wird nicht mehr mit BOINCSIMAPist. SIMAP2 wird nicht mehr mit BOINCSIMAP
rdfs:label Similarity Matrix of Proteins , SIMAP , SIMAP@home , مصفوفة تشابه البروتينات
hide properties that link here 
http://dbpedia.org/resource/List_of_biological_databases + , http://dbpedia.org/resource/ENCODE + , http://dbpedia.org/resource/Rosetta@home + , http://dbpedia.org/resource/Berkeley_Open_Infrastructure_for_Network_Computing + , http://dbpedia.org/resource/List_of_volunteer_computing_projects + , http://dbpedia.org/resource/Sequence_database + , http://dbpedia.org/resource/Predictor@home + , http://dbpedia.org/resource/SIMAP + http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
http://en.wikipedia.org/wiki/Similarity_Matrix_of_Proteins + http://xmlns.com/foaf/0.1/primaryTopic
 

 

Enter the name of the page to start semantic browsing from.