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إعادة بناء وتحفيز شبكة الأيض يسمح بنظرة في العمق إلى الآليات الجزيئية لكائن حي معين. وبالتحديد, فإن هذه النماذج تربط الجينوم بعلم وظائف الأعضاء الجزيئي.
, La reconstrucción y simulación de rutas me … La reconstrucción y simulación de rutas metabólicas permite una visión más detallada de los mecanismos moleculares de un organismo en específico. En particular, estos modelos correlacionan el genoma con la fisiología molecular. Una reconstrucción rompe las vías metabólicas (tales como la glucólisis y el ciclo del ácido cítrico) en sus respectivas reacciones y enzimas, y los analiza en la perspectiva de una red entera. En términos simples, una reconstrucción reúne toda la información metabólica relevante de un organismo y la compila en un modelo matemático. La validación y el análisis de las reconstrucciones permite la identificación de características clave del metabolismo, como el rendimiento del crecimiento, la distribución de recursos, la robustez de la red y la esencialidad de genes. Este conocimiento puede ser aplicado para la creación de biotecnología novedosa. En general, el proceso para elaborar una reconstrucción es el siguiente: 1.
* Hacer un borrador de la reconstrucción 2.
* Clarificar el modelo 3.
* Convertir el modelo en una representación matemática o computacional 4.
* Evaluar y depurar el modelo por medio de experimentaciónrar el modelo por medio de experimentación
, El modelatge i reconstrucció de xarxes met … El modelatge i reconstrucció de xarxes metabòliques permet un enfocament detallat per la comprensió dels mecanismes moleculars d'un determinat organisme, especialment en la corelació del genoma amb la fisiologia molecular. Una reconstrucció descompon les rutes metabòliques en els seus enzims i reaccions específics, i els analitza dins el marc de la xarxa completa. Alguns exemples de rutes metabòliques són la glicòlisi, el cicle de Krebs, la ruta de la pentosa fosfat, etc. De manera simplificada, una reconstrucció implica recollir tota la informació rellevant sobre el metabolisme d'un organisme i llavors fixar-la d'una manera en què se la pugui analitzar de diverses maneres.se la pugui analitzar de diverses maneres.
, Metabolic network modelling, also known as … Metabolic network modelling, also known as metabolic network reconstruction or metabolic pathway analysis, allows for an in-depth insight into the molecular mechanisms of a particular organism. In particular, these models correlate the genome with molecular physiology. A reconstruction breaks down metabolic pathways (such as glycolysis and the citric acid cycle) into their respective reactions and enzymes, and analyzes them within the perspective of the entire network. In simplified terms, a reconstruction collects all of the relevant metabolic information of an organism and compiles it in a mathematical model. Validation and analysis of reconstructions can allow identification of key features of metabolism such as growth yield, resource distribution, network robustness, and gene essentiality. This knowledge can then be applied to create novel biotechnology. In general, the process to build a reconstruction is as follows: 1.
* Draft a reconstruction 2.
* Refine the model 3.
* Convert model into a mathematical/computational representation 4.
* Evaluate and debug model through experimentation The related method of flux balance analysis seeks to mathematically simulate metabolism in genome-scale reconstructions of metabolic networks.ale reconstructions of metabolic networks.
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El modelatge i reconstrucció de xarxes met … El modelatge i reconstrucció de xarxes metabòliques permet un enfocament detallat per la comprensió dels mecanismes moleculars d'un determinat organisme, especialment en la corelació del genoma amb la fisiologia molecular. Una reconstrucció descompon les rutes metabòliques en els seus enzims i reaccions específics, i els analitza dins el marc de la xarxa completa. Alguns exemples de rutes metabòliques són la glicòlisi, el cicle de Krebs, la ruta de la pentosa fosfat, etc. De manera simplificada, una reconstrucció implica recollir tota la informació rellevant sobre el metabolisme d'un organisme i llavors fixar-la d'una manera en què se la pugui analitzar de diverses maneres.se la pugui analitzar de diverses maneres.
, Metabolic network modelling, also known as … Metabolic network modelling, also known as metabolic network reconstruction or metabolic pathway analysis, allows for an in-depth insight into the molecular mechanisms of a particular organism. In particular, these models correlate the genome with molecular physiology. A reconstruction breaks down metabolic pathways (such as glycolysis and the citric acid cycle) into their respective reactions and enzymes, and analyzes them within the perspective of the entire network. In simplified terms, a reconstruction collects all of the relevant metabolic information of an organism and compiles it in a mathematical model. Validation and analysis of reconstructions can allow identification of key features of metabolism such as growth yield, resource distribution, network robustness, and gene essentialon, network robustness, and gene essential
, إعادة بناء وتحفيز شبكة الأيض يسمح بنظرة في العمق إلى الآليات الجزيئية لكائن حي معين. وبالتحديد, فإن هذه النماذج تربط الجينوم بعلم وظائف الأعضاء الجزيئي.
, La reconstrucción y simulación de rutas me … La reconstrucción y simulación de rutas metabólicas permite una visión más detallada de los mecanismos moleculares de un organismo en específico. En particular, estos modelos correlacionan el genoma con la fisiología molecular. Una reconstrucción rompe las vías metabólicas (tales como la glucólisis y el ciclo del ácido cítrico) en sus respectivas reacciones y enzimas, y los analiza en la perspectiva de una red entera. En términos simples, una reconstrucción reúne toda la información metabólica relevante de un organismo y la compila en un modelo matemático. La validación y el análisis de las reconstrucciones permite la identificación de características clave del metabolismo, como el rendimiento del crecimiento, la distribución de recursos, la robustez de la red y la esencialidad de genes.stez de la red y la esencialidad de genes.
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نمذجة الشبكة الأيضية
, Modelatge de xarxes metabòliques
, Modelado de redes metabólicas
, Metabolic network modelling
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