| http://dbpedia.org/ontology/abstract
|
SNED1 (Sushi, Nidogen, and EGF-like Domain … SNED1 (Sushi, Nidogen, and EGF-like Domains) is an extracellular matrix (ECM) protein expressed at low levels in a wide range of tissues. The gene encoding SNED1 is located in the human chromosome 2 at locus q37.3. The corresponding mRNA isolated from the spleen and is 6834bp in length, and the corresponding protein is 1413 amino-acid long. The mouse ortholog of SNED1 was cloned in 2004 from the embryonic kidney by Leimester et al. SNED1 present domains characteristic of ECM proteins, including an amino-terminal NIDO domain, several calcium binding EGF-like domains (EGF_CA), a Sushi domain also known as complement control protein (CCP) domain, and three type III fibronectin (FN3) domains in the carboxy-terminal region.3) domains in the carboxy-terminal region.
, SNED1 (англ. Sushi, nidogen and EGF like d … SNED1 (англ. Sushi, nidogen and EGF like domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 413 амінокислот, а молекулярна маса — 152 204. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні.ння з іоном кальцію. Секретований назовні.
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageExternalLink
|
http://smart.embl-heidelberg.de/smart/do_annotation.pl%3FDOMAIN=NIDO&BLAST=DUMMY +
, https://smart.embl.de/smart/show_motifs.pl%3FID=Q8TER0 +
, https://www.uniprot.org/uniprot/Q8TER0 +
, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/122937283%3Freport=genbank&log%24=protalign&blast_rank=1&RID=T7EWA75B015 +
, https://www.ebi.ac.uk/interpro/protein/UniProt/Q8TER0/ +
, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001080437.3 +
, https://www.genenames.org/data/gene-symbol-report/%23%21/hgnc_id/HGNC:24696 +
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID
|
39280133
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength
|
19773
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID
|
1064880501
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
|
http://dbpedia.org/resource/Fibronectin_type_III_domain +
, http://dbpedia.org/resource/T-plasminogen_activator +
, http://dbpedia.org/resource/Somatostatin +
, http://dbpedia.org/resource/Spermine_synthase +
, http://dbpedia.org/resource/Protein_kinase_A +
, http://dbpedia.org/resource/Somatostatin_receptor_2 +
, http://dbpedia.org/resource/Transcription_factor +
, http://dbpedia.org/resource/Sushi_domain +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Glycoproteins +
, http://dbpedia.org/resource/Calcium-binding_EGF_domain +
, http://dbpedia.org/resource/File:Conceptual_translation_of_SNED1_Annotated.pdf +
, http://dbpedia.org/resource/Factor_IX +
, http://dbpedia.org/resource/Protein_kinase_C +
, http://dbpedia.org/resource/Complement_control_protein +
, http://dbpedia.org/resource/Plasmin +
, http://dbpedia.org/resource/Integrin +
, http://dbpedia.org/resource/Low_density_lipoprotein_receptor-related_protein_4 +
, http://dbpedia.org/resource/Fibrolytic +
, http://dbpedia.org/resource/Anosmin_1 +
, http://dbpedia.org/resource/Entactin +
, http://dbpedia.org/resource/NRXN1 +
, http://dbpedia.org/resource/EGF-like_domain +
, http://dbpedia.org/resource/Upstream_open_reading_frame +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Extracellular_matrix_proteins +
, http://dbpedia.org/resource/Extracellular_matrix +
, http://dbpedia.org/resource/Basement_membrane +
, http://dbpedia.org/resource/Fibrillin-1 +
, http://dbpedia.org/resource/Collagen +
|
| http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate
|
http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist +
|
| http://purl.org/dc/terms/subject
|
http://dbpedia.org/resource/Category:Extracellular_matrix_proteins +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Glycoproteins +
|
| http://purl.org/linguistics/gold/hypernym
|
http://dbpedia.org/resource/Protein +
|
| http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
|
http://en.wikipedia.org/wiki/SNED1?oldid=1064880501&ns=0 +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf
|
http://en.wikipedia.org/wiki/SNED1 +
|
| owl:sameAs |
http://www.wikidata.org/entity/Q18037857 +
, https://global.dbpedia.org/id/gUNA +
, http://www.wikidata.org/entity/Q17156959 +
, http://dbpedia.org/resource/SNED1 +
, http://yago-knowledge.org/resource/SNED1 +
, http://rdf.freebase.com/ns/m.0vsjq4k +
, http://tt.dbpedia.org/resource/SNED1 +
, http://uk.dbpedia.org/resource/SNED1 +
|
| rdf:type |
http://dbpedia.org/ontology/Protein +
, http://dbpedia.org/class/yago/WikicatProteins +
, http://dbpedia.org/class/yago/Part113809207 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Relation100031921 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Matter100020827 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Protein114728724 +
, http://dbpedia.org/class/yago/OrganicCompound114727670 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Material114580897 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Macromolecule114944888 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Molecule114682133 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Unit109465459 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Compound114818238 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Abstraction100002137 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Chemical114806838 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Substance100019613 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Thing100002452 +
, http://dbpedia.org/class/yago/PhysicalEntity100001930 +
|
| rdfs:comment |
SNED1 (Sushi, Nidogen, and EGF-like Domain … SNED1 (Sushi, Nidogen, and EGF-like Domains) is an extracellular matrix (ECM) protein expressed at low levels in a wide range of tissues. The gene encoding SNED1 is located in the human chromosome 2 at locus q37.3. The corresponding mRNA isolated from the spleen and is 6834bp in length, and the corresponding protein is 1413 amino-acid long. The mouse ortholog of SNED1 was cloned in 2004 from the embryonic kidney by Leimester et al. SNED1 present domains characteristic of ECM proteins, including an amino-terminal NIDO domain, several calcium binding EGF-like domains (EGF_CA), a Sushi domain also known as complement control protein (CCP) domain, and three type III fibronectin (FN3) domains in the carboxy-terminal region.3) domains in the carboxy-terminal region.
, SNED1 (англ. Sushi, nidogen and EGF like d … SNED1 (англ. Sushi, nidogen and EGF like domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 413 амінокислот, а молекулярна маса — 152 204. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: ТирозиннT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин
|
| rdfs:label |
SNED1
|
