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Http://dbpedia.org/resource/Polarizable continuum model
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http://dbpedia.org/resource/Polarizable_continuum_model
http://dbpedia.org/ontology/abstract Il modello del continuo polarizzabile (spesso abbreviato PCM) è un modello ampiamente usato in chimica computazionale nel calcolo degli effetti della solvatazione, ossia dell'interazione con l'ambiente locale, di una specie chimica. , Model polarizovaného kontinua (anglicky PoModel polarizovaného kontinua (anglicky Polarizable continuum model (PCM)) je model polarizovaného kontinua, používaný při kvantově chemických výpočtech (například pomocí programu ). Model zastupuje rozpouštědlo, v němž je molekula uložená. Kavita (prostor) rozpouštědla je tvořen několika překrývajícími se sférami, jejichž středy jsou těžké atomy. Poloměr sfér je většinou volen tak, aby atomy vodíku byly uvnitř sféry atomu, k němuž jsou vázány.y uvnitř sféry atomu, k němuž jsou vázány. , The polarizable continuum model (PCM) is aThe polarizable continuum model (PCM) is a commonly used method in computational chemistry to model solvation effects. If it were necessary to consider each solvent molecule as a separate molecule, the computational cost of modeling a solvent-mediated chemical reaction would grow prohibitively high. Modeling the solvent as a polarizable continuum, rather than individual molecules, makes ab initio computation feasible. Two types of PCMs have been popularly used: the dielectric PCM (D-PCM) in which the continuum is polarizable (see dielectrics) and the conductor-like PCM (C-PCM) in which the continuum is conductor-like similar to COSMO Solvation Model. The molecular free energy of solvation is computed as the sum of three terms: Gsol = Ges + Gdr + GcavGes = electrostaticGdr = dispersion-repulsionGcav = cavitation The Charge-transfer effect is also considered as a part of solvation in cases. The PCM solvation model is available for calculating energies and gradients at the Hartree–Fock and density functional theory (DFT) levels in several quantum chemical computational packages such as Gaussian, GAMESS and JDFTx. However, it has been revealed that the VdW radius value employed in the default PCM/UA0 model in the Gaussian 03 Program Package is too short and results in erroneous redundant imaginary frequency RIFs in normal modes analyses, for compounds containing Li atoms. A novel set of VdW radii based on electron density topology, for selected elements in the periodic table is described herein. The accuracy and reliability have been affirmed by the demonstrated elimination of erroneous default PCM/UA0-generated RIFs. And continuous efforts are being made to modify the radii implemented in these programs. The authors of a 2002 paper observe that PCM has limitations where non-electrostatic effects dominate the solute-solvent interactions. They write in the abstract: "Since only electrostatic solute-solvent interactions are included in the PCM, our results lead to the conclusion that, for the seven molecules studied, in cyclohexane, acetone, methanol, and acetonitrile electrostatic effects are dominant while in carbon tetrachloride, benzene, and chloroform other nonelectrostatic effects are more important." There is an integral equation formalism (IEF) version of the PCM which is very commonly used. PCM is also used to model outer solvation layers in multi-layered solvation approach.ayers in multi-layered solvation approach. , 分極連続体モデル(ぶんきょくれんぞくたいモデル、polarizable contin分極連続体モデル(ぶんきょくれんぞくたいモデル、polarizable continuum model, PCM)とは、計算化学の分野において溶媒効果を取り扱うために広く用いられる手法である。溶媒仲介反応をモデル化する際、溶媒を構成する分子1つ1つを別個に分子として取り扱うと計算コストが大きくなりすぎてしまい、取り扱うことができなくなる。そこで、溶媒を分子の形ではなく分極する連続体として扱えば、第一原理計算が可能となる。よく使われる分極連続体モデルには2種類あり、1つは連続体を分極するものとして扱う誘電体分極連続体モデル (dielectric PCM, D-PCM) 、もう1つは連続体を COSMO 法 で用いられるものに似た、導電体的なものとして扱う C-PCM (conductor-like PCM) である。 分子の溶媒和ギブズエネルギーは次のように3つの項の和として表わされる。 Gsol = Ges + Gdr + GcavGes =静電項Gdr =分散力-斥力項Gcav =キャビテーション項 電荷移動効果も溶媒和の一部として扱われる場合がある。 PCM 溶媒和モデルは、GAUSSIAN, GAMESS, JDFTx などの量子化学計算パッケージにおいて、1点エネルギー計算および勾配計算が可能な形で利用できる。 2002年発表の論文の著者らは、溶質・溶媒相互作用において非静電的効果が支配的な場合、PCM での取扱に限界があることを観察している。以下にその論文の概要からの引用を示す。 "Since only electrostatic solute-solvent interactions are included in the PCM, our results lead to the conclusion that, for the seven molecules studied, in cyclohexane, acetone, methanol, and acetonitrile electrostatic effects are dominant while in carbon tetrachloride, benzene, and chloroform other nonelectrostatic effects are more important." PCM を積分方程式形式に直したものも広く用いられている。 PCM は、多層溶媒和アプローチにおける外層溶媒和の取扱いにも用いられる。ている。 PCM は、多層溶媒和アプローチにおける外層溶媒和の取扱いにも用いられる。
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rdfs:label Polarizable continuum model , Model polarizovaného kontinua , Modello del continuo polarizzabile , 分極連続体モデル
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