| http://dbpedia.org/ontology/abstract
|
Photo-reactive amino acid analogs are arti … Photo-reactive amino acid analogs are artificial analogs of natural amino acids that can be used for crosslinking of protein complexes. Photo-reactive amino acid analogs may be incorporated into proteins and peptides in vivo or in vitro. Photo-reactive amino acid analogs in common use are photoreactive diazirine analogs to leucine and methionine, and para-benzoylphenylalanine. Upon exposure to ultraviolet light, they are activated and covalently bind to interacting proteins that are within a few angstroms of the photo-reactive amino acid analog. L-Photo-leucine and L-photo-methionine are analogs of the naturally occurring L-leucine and L-methionine amino acids that are endogenously incorporated into the primary sequence of proteins during synthesis using the normal translation machinery. They are then ultraviolet light (UV)-activated to covalently crosslink proteins within protein–protein interaction domains in their native in-vivo environment. The method enables the determination and characterization of both stable and transient protein interactions in cells without the addition of chemical crosslinkers and associated solvents that can adversely affect the cell biology being studied in the experiment. When used in combination with limiting media that is devoid of leucine and methionine, the photo-activatable derivatives are treated like naturally occurring amino acids by the cellular protein synthesis machinery. As a result, they can be substituted for leucine or methionine in the primary structure of proteins. Photo-leucine and photo-methionine derivatives contain diazirine rings that are activated when exposed to UV light to become reactive intermediates that form covalent bonds with nearby protein side chains and backbones. Naturally interacting proteins within the cell can be instantly trapped by photoactivation of the diazirine-containing proteins in the cultured cells. Crosslinked protein complexes can be detected by decreased mobility on SDS-PAGE followed by Western blotting, size exclusion chromatography, sucrose density gradient sedimentation or mass spectrometry.adient sedimentation or mass spectrometry.
, Un aminoàcid anàleg fotoreactiu és un tipu … Un aminoàcid anàleg fotoreactiu és un tipus d'aminoàcid artificial, anàleg als naturals, que pot ésser incorporat a proteïnes i pèptids amb la principal finalitat de detectar interaccions entre diverses proteïnes. Aquestes interaccions entre proteïnes són de vital importància per als processos cel·lulars (metabolisme, comunicació...) que es desenvolupen a l'interior dels organismes vius. Des de l'era genòmica va sorgir la important necessitat de saber quines són les organitzacions i xarxes proteiques que controlen les funcions cel·lulars, i són molts els estudis que han demostrat que la major part de les proteïnes funcionen com a complexos: interaccionant entre elles -reticulació- i no pas com a unitats individuals i separades. Uns exemples d'aquests aminoàcids fotoreactius són: la fotometionina -amb fórmula molecular C6H11N3O2- que deriva de la metionina (C5H11NO2S), o la fotoleucina (C5H9N3O2) que deriva de la leucina (C6H13NO2). Per tant, detectar aquestes interaccions i relacions entre les proteïnes serà molt important; no només per la investigació bàsica sinó també pel desenvolupament de tractaments i fàrmacs. desenvolupament de tractaments i fàrmacs.
, نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً هي … نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً هي مجموعة من النظائر الاصطناعية من الأحماض الأمينية الطبيعية التي يمكن استخدامها لربط مركبات البروتين. ويمكن دمج نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً مع البروتينات والببتيدات في الجسم الحي أو في المختبر. وتتمثل نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً شائعة الاستخدام في نظائر الديازيرين الفعّالة ضوئياً واللوسين والميثيونين وبي-بينزويلافينيلانين. وعند التعرّض إلى الأشعة فوق البنفسجية، يتم تنشيط هذه النظائر وربطها بشكلٍ تساهمي للتفاعل مع البروتينات التي تدخل في نطاق عددٍ قليل من وحدات الأنغستروم الخاصة بنظير الحمض الأميني الفعّال ضوئياً. وتُعد نظائر اللوسين-الضوئية L (L-Photo-Leucine) ونظائر الميثيونين-الضوئية-L (L-Photo-Methionine) نظائر الأحماض الأمينية المتمثلة في اللوسين-L والميثيونين-L والتي تظهر بشكلٍ طبيعي، ويتم إدراجها في التسلسل الرئيس للبروتينات خلال التركيب باستخدام آليات الانتقال العادية. ويتم بعد ذلك تنشيطها باستخدام الأشعة فوق البنفسجية لربط البروتينات بشكلٍ تساهمي في نطاقات تفاعل البروتين-البروتين في بيئتها الأصلية الحيوية. وتساعد الطريقة في تحديد خصائص كلٍ من تفاعلات البروتين الثابتة والعابرة في الخلايا بدون إضافة روابط كيميائية ومذيبات مرتبطة بها، والتي يمكن أن تؤثر سلبًا على البيولوجيا الخلوية قيد الدراسة في التجربة. وعندما يتم استخدامها في تركيبةٍ محدودة الوسائط وتخلو من اللوسين والميثيونين، يتم التعامل مع المشتقات الفعّالة ضوئياً كما لو كانت أحماض أمينية تحدث بشكل طبيعي من خلال آلية تخليق البروتين الخلوي. وكنتيجةٍ لذلك، يمكنها أن تكون بديلاً للوسين أو الميثيونين في الهيكل الأساسي للبروتينات. وتحتوي مشتقات اللوسين الضوئي والميثيونين الضوئي على حلقات الديازيرين التي يتم تنشيطها عند التعرض للأشعة فوق البنفسجية لتصبح الوسيطة التفاعلية التي تشكل روابط تساهمية مع السلاسل والدعامات الجانبية البروتينية المجاورة. ويمكن بطبيعة الحال محاصرة البروتينات المتفاعلة داخل الخليّة على الفور بواسطة التنشيط الضوئي للبروتينات التي تحتوي على الديازيرين في الخلايا المزروعة. ويمكن الكشف عن مركبات البروتين المترابطة عن طريق تقليل الحركة على طريقة «إس دي إس بايج» (دودسيل كبريتات الصوديوم متعدد الأكريلاميد "SDS-PAGE") متبوعة باختبار اللطخة الغربيّة أو حجم الاستبعاد اللوني أو الترسيب متدرج الكثافة للسكروز أو قياس الطيف الكتلي.تدرج الكثافة للسكروز أو قياس الطيف الكتلي.
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageExternalLink
|
http://www.genengnews.com/articles/chitem.aspx%3Faid=2427 +
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID
|
14136041
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength
|
4057
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID
|
1094396066
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
|
http://dbpedia.org/resource/Category:Protein%E2%80%93protein_interaction_assays +
, http://dbpedia.org/resource/Size_exclusion_chromatography +
, http://dbpedia.org/resource/Photoactivation +
, http://dbpedia.org/resource/Methionine +
, http://dbpedia.org/resource/Western_blot +
, http://dbpedia.org/resource/Leucine +
, http://dbpedia.org/resource/Covalent_bonds +
, http://dbpedia.org/resource/Mass_spectrometry +
, http://dbpedia.org/resource/Angstrom +
, http://dbpedia.org/resource/Photochemistry +
, http://dbpedia.org/resource/Diazirine +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Proteomics +
, http://dbpedia.org/resource/L-Photo-leucine +
, http://dbpedia.org/resource/L-Photo-methionine +
, http://dbpedia.org/resource/Cell_biology +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Biochemistry_methods +
, http://dbpedia.org/resource/Protein_synthesis +
, http://dbpedia.org/resource/Sucrose +
, http://dbpedia.org/resource/Ultraviolet_light +
, http://dbpedia.org/resource/Protein%E2%80%93protein_interaction +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Biotechnology +
|
| http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate
|
http://dbpedia.org/resource/Template:Doi +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist +
|
| http://purl.org/dc/terms/subject
|
http://dbpedia.org/resource/Category:Proteomics +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Protein%E2%80%93protein_interaction_assays +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Biotechnology +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Biochemistry_methods +
|
| http://purl.org/linguistics/gold/hypernym
|
http://dbpedia.org/resource/Analogs +
|
| http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Photo-reactive_amino_acid_analog?oldid=1094396066&ns=0 +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Photo-reactive_amino_acid_analog +
|
| owl:sameAs |
http://rdf.freebase.com/ns/m.03cvpnc +
, http://ca.dbpedia.org/resource/Amino%C3%A0cid_an%C3%A0leg_fotoreactiu +
, https://global.dbpedia.org/id/4tfMA +
, http://www.wikidata.org/entity/Q7187642 +
, http://dbpedia.org/resource/Photo-reactive_amino_acid_analog +
, http://yago-knowledge.org/resource/Photo-reactive_amino_acid_analog +
, http://ar.dbpedia.org/resource/%D9%86%D8%B8%D8%A7%D8%A6%D8%B1_%D8%A7%D9%84%D8%A3%D8%AD%D9%85%D8%A7%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%A3%D9%85%D9%8A%D9%86%D9%8A%D8%A9_%D8%A7%D9%84%D9%81%D8%B9%D8%A7%D9%84%D8%A9_%D8%B6%D9%88%D8%A6%D9%8A%D8%A7 +
|
| rdf:type |
http://dbpedia.org/class/yago/Method105660268 +
, http://dbpedia.org/class/yago/PsychologicalFeature100023100 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Know-how105616786 +
, http://dbpedia.org/class/yago/WikicatBiochemistryMethods +
, http://dbpedia.org/class/yago/Ability105616246 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Cognition100023271 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Classification105732756 +
, http://dbpedia.org/class/yago/WikicatProtein%E2%80%93proteinInteractionAssays +
, http://dbpedia.org/ontology/ChemicalSubstance +
, http://dbpedia.org/class/yago/Appraisal105733583 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Assay105738625 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Abstraction100002137 +
, http://dbpedia.org/class/yago/Process105701363 +
, http://dbpedia.org/class/yago/BasicCognitiveProcess105701944 +
|
| rdfs:comment |
Photo-reactive amino acid analogs are arti … Photo-reactive amino acid analogs are artificial analogs of natural amino acids that can be used for crosslinking of protein complexes. Photo-reactive amino acid analogs may be incorporated into proteins and peptides in vivo or in vitro. Photo-reactive amino acid analogs in common use are photoreactive diazirine analogs to leucine and methionine, and para-benzoylphenylalanine. Upon exposure to ultraviolet light, they are activated and covalently bind to interacting proteins that are within a few angstroms of the photo-reactive amino acid analog.s of the photo-reactive amino acid analog.
, Un aminoàcid anàleg fotoreactiu és un tipu … Un aminoàcid anàleg fotoreactiu és un tipus d'aminoàcid artificial, anàleg als naturals, que pot ésser incorporat a proteïnes i pèptids amb la principal finalitat de detectar interaccions entre diverses proteïnes. Uns exemples d'aquests aminoàcids fotoreactius són: la fotometionina -amb fórmula molecular C6H11N3O2- que deriva de la metionina (C5H11NO2S), o la fotoleucina (C5H9N3O2) que deriva de la leucina (C6H13NO2).N3O2) que deriva de la leucina (C6H13NO2).
, نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً هي … نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً هي مجموعة من النظائر الاصطناعية من الأحماض الأمينية الطبيعية التي يمكن استخدامها لربط مركبات البروتين. ويمكن دمج نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً مع البروتينات والببتيدات في الجسم الحي أو في المختبر. وتتمثل نظائر الأحماض الأمينية الفعّالة ضوئياً شائعة الاستخدام في نظائر الديازيرين الفعّالة ضوئياً واللوسين والميثيونين وبي-بينزويلافينيلانين. وعند التعرّض إلى الأشعة فوق البنفسجية، يتم تنشيط هذه النظائر وربطها بشكلٍ تساهمي للتفاعل مع البروتينات التي تدخل في نطاق عددٍ قليل من وحدات الأنغستروم الخاصة بنظير الحمض الأميني الفعّال ضوئياً.الخاصة بنظير الحمض الأميني الفعّال ضوئياً.
|
| rdfs:label |
نظائر الأحماض الأمينية الفعالة ضوئيا
, Aminoàcid anàleg fotoreactiu
, Photo-reactive amino acid analog
|
