| http://dbpedia.org/ontology/abstract
|
Multiple EM for Motif Elicitation (MEME) — … Multiple EM for Motif Elicitation (MEME) — алгоритм и одноимённый инструмент, являющийся реализацией алгоритма, для поиска мотивов в биологических последовательностях белков и ДНК. Алгоритм основан на многократном применении метода максимального правдоподобия. Под мотивом понимается короткая последовательность нуклеотидов или аминокислот, общая для некоторого набора последовательностей. Поиск мотивов — важная задача в биологии, так как наличие мотива в последовательности может служить сигналом к распознаванию последовательности для транскрипционных факторов или эндонуклеаз рестрикции.онных факторов или эндонуклеаз рестрикции.
, Multiple Expectation maximizations for Mot … Multiple Expectation maximizations for Motif Elicitation (MEME) is a tool for discovering motifs in a group of related DNA or protein sequences. A motif is a sequence pattern that occurs repeatedly in a group of related protein or DNA sequences and is often associated with some biological function. MEME represents motifs as position-dependent letter-probability matrices which describe the probability of each possible letter at each position in the pattern. Individual MEME motifs do not contain gaps. Patterns with variable-length gaps are split by MEME into two or more separate motifs. MEME takes as input a group of DNA or protein sequences (the training set) and outputs as many motifs as requested. It uses statistical modeling techniques to automatically choose the best width, number of occurrences, and description for each motif. MEME is the first of a collection of tools for analyzing motifs called the MEME suite.or analyzing motifs called the MEME suite.
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageExternalLink
|
https://sites.google.com/site/yongchaosoftware/Home/cuda-meme +
, https://github.com/uci-cbcl/EXTREME +
, http://meme-suite.org/ +
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageID
|
9503346
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageLength
|
3267
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageRevisionID
|
1053694106
|
| http://dbpedia.org/ontology/wikiPageWikiLink
|
http://dbpedia.org/resource/Protein +
, http://dbpedia.org/resource/Greedy_search +
, http://dbpedia.org/resource/Position_weight_matrix +
, http://dbpedia.org/resource/Maximum_likelihood +
, http://dbpedia.org/resource/Sequence_alignment +
, http://dbpedia.org/resource/DNA +
, http://dbpedia.org/resource/Category:Bioinformatics +
, http://dbpedia.org/resource/Sequence_motif +
, http://dbpedia.org/resource/MEME_suite +
, http://dbpedia.org/resource/Expectation_maximization +
|
| http://dbpedia.org/property/wikiPageUsesTemplate
|
http://dbpedia.org/resource/Template:Other_uses +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Reflist +
, http://dbpedia.org/resource/Template:Cn +
|
| http://purl.org/dc/terms/subject
|
http://dbpedia.org/resource/Category:Bioinformatics +
|
| http://purl.org/linguistics/gold/hypernym
|
http://dbpedia.org/resource/Tool +
|
| http://www.w3.org/ns/prov#wasDerivedFrom
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_EM_for_Motif_Elicitation?oldid=1053694106&ns=0 +
|
| http://xmlns.com/foaf/0.1/isPrimaryTopicOf
|
http://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_EM_for_Motif_Elicitation +
|
| owl:sameAs |
http://rdf.freebase.com/ns/m.02pgz96 +
, http://dbpedia.org/resource/Multiple_EM_for_Motif_Elicitation +
, https://global.dbpedia.org/id/4s7ZR +
, http://www.wikidata.org/entity/Q6934888 +
, http://ru.dbpedia.org/resource/MEME +
, http://fa.dbpedia.org/resource/%D8%A7%DB%8C%E2%80%8C%D8%A7%D9%85_%DA%86%D9%86%D8%AF%DA%AF%D8%A7%D9%86%D9%87_%D8%A8%D8%B1%D8%A7%DB%8C_%D8%A7%D8%B3%D8%AA%D8%AE%D8%B1%D8%A7%D8%AC_%D9%85%D9%88%D8%AA%DB%8C%D9%81 +
|
| rdf:type |
http://dbpedia.org/ontology/Software +
|
| rdfs:comment |
Multiple Expectation maximizations for Mot … Multiple Expectation maximizations for Motif Elicitation (MEME) is a tool for discovering motifs in a group of related DNA or protein sequences. A motif is a sequence pattern that occurs repeatedly in a group of related protein or DNA sequences and is often associated with some biological function. MEME represents motifs as position-dependent letter-probability matrices which describe the probability of each possible letter at each position in the pattern. Individual MEME motifs do not contain gaps. Patterns with variable-length gaps are split by MEME into two or more separate motifs. by MEME into two or more separate motifs.
, Multiple EM for Motif Elicitation (MEME) — … Multiple EM for Motif Elicitation (MEME) — алгоритм и одноимённый инструмент, являющийся реализацией алгоритма, для поиска мотивов в биологических последовательностях белков и ДНК. Алгоритм основан на многократном применении метода максимального правдоподобия. Под мотивом понимается короткая последовательность нуклеотидов или аминокислот, общая для некоторого набора последовательностей. Поиск мотивов — важная задача в биологии, так как наличие мотива в последовательности может служить сигналом к распознаванию последовательности для транскрипционных факторов или эндонуклеаз рестрикции.онных факторов или эндонуклеаз рестрикции.
|
| rdfs:label |
Multiple EM for Motif Elicitation
, MEME
|
